برنامه سلامت جوانان در ابتدا به شکل ادغام یافته با اداره سلامت نوجوانان و مدارس در سال 87 آغاز گردید. اما در همان سالها تمرکز عمده برنامه روی جمعیت نوجوانان در مدرسه بود به علت اینکه در دسترس بودند و دسترسی به ایشان دسترسی به والدینشان را محتمل می ساخت در آن سالها بودجه برنامه با تمرکز بر جمعیت متمرکز در مدارس با رویکرد گسترش مراقبت های سلامتی دانش آموزان هزینه می شد و هزینه ای به برنامه جوانان اختصاص نداشت در سال 89 با نقب زنی به بودجه مدارس بخشی از فعالیتهای جوانان ساماندهی شد لازم به ذکر است که جوانان از نگاه وزارت ورزش و جوانان گروه سنی 29-15سال است که در دفتر سلامت  جمعیت خانواده ومدارس این گروه با نـظر مـدیریت محـترم دفـتر گروه سـنی 29-18سـل تعریف شده است.  در سال 89 تعامل با وزارت علوم در خصوص گسترش پوشـش خدمات خودمراقبتی به جوانان آغاز گردید که متاسفانه به دلیل نبود بودجه کافی به ثمر نرسید و فعالیتها به معاونت فرهنگی دانشجویی تابعه وزارت بهداشت محدود شد سپس  از آن سال معاینات جسمانی و روانی با تدوین بسته خدمت مختص جوانان و شناسنامه مناسب  با آن گرو سنی  توسط مراقبین سلامت وبهورزان در مراکز بهداشتی درمانی ؛پایگاههای بهداشتی ؛پایگاههای سلامت وخانه های بهداشت درحال انجام است.